Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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