Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms