Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP2Q9UDT6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms