Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CELF4Q9BZC1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms