Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD247P20963 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD247P20963 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms