Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NFKB1P19838 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NFKB1P19838 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NFKB1P19838 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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