Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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