Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms