Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms