Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms