Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms