Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms