Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM35Q9UPQ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms