Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXL2Q9NZ53 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXL2Q9NZ53 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXL2Q9NZ53 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms