Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RDH8Q9NYR8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms