Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAF1Q9H7N4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF1Q9H7N4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms