Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A3Q9H7F0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms