Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC8Q9H0W5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC8Q9H0W5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms