Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JAM3Q9BX67 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JAM3Q9BX67 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms