Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS8Q99627 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms