Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC62Q99442 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC62Q99442 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms