Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UIMC1Q96RL1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms