Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEIL1Q96FI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms