Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFAP3Q92845 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms