Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3AQ92484 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMPDL3AQ92484 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMPDL3AQ92484 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPDL3AQ92484 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPDL3AQ92484 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPDL3AQ92484 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms