Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC91Q7Z6B0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC91Q7Z6B0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC91Q7Z6B0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms