Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms