Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM1Q6UX27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms