Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO42Q6P3S6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO42Q6P3S6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms