Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms