Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBRD2Q68DH5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms