Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALFQ53S48 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms