Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDCCQ504Y2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms