Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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