Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDC1Q14676 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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