Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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