Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 WDR82-204ENST00000487402 4333 ntTSL 29.96□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 9.9
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GRSF1Q12849 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 216.63■□□□□ 0.252e-12■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 EPHA2-202ENST00000461614 875 ntTSL 226.51■■□□□ 1.833e-8■□□□□ 9.9
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GRSF1Q12849 F10-206ENST00000483537 564 ntTSL 210.05□□□□□ -0.83e-8■□□□□ 9.9
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GRSF1Q12849 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.454e-11■□□□□ 9.8
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GRSF1Q12849 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 212.69□□□□□ -0.384e-11■□□□□ 9.8
GRSF1Q12849 SMDT1-203ENST00000484235 556 ntTSL 1 (best)27.82■■■□□ 2.041e-8■□□□□ 9.8
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GRSF1Q12849 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-16■□□□□ 9.7
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GRSF1Q12849 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.921e-16■□□□□ 9.7
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GRSF1Q12849 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.911e-10■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-212ENST00000583111 574 ntTSL 220.09■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 EIF3B-212ENST00000494658 637 ntTSL 218.78■□□□□ 0.61e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-206ENST00000580033 547 ntTSL 417.92■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-205ENST00000579121 637 ntTSL 316.77■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-10■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-215ENST00000583868 815 ntTSL 314.58□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 TOP2B-203ENST00000424225 3525 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.341e-10■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 ARHGDIA-204ENST00000578351 421 ntTSL 412.7□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.51e-10■□□□□ 9.7
GRSF1Q12849 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.683e-9■□□□□ 9.6
GRSF1Q12849 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 223.08■■□□□ 1.283e-9■□□□□ 9.6
GRSF1Q12849 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 518.96■□□□□ 0.633e-9■□□□□ 9.6
GRSF1Q12849 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■□□□□ 9.6
GRSF1Q12849 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■□□□□ 9.6
GRSF1Q12849 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-8■□□□□ 9.6
GRSF1Q12849 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.383e-10■□□□□ 9.6
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