Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms