Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms