Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4A11Q02928 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms