Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms