Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MYBPC1Q00872 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYBPC1Q00872 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms