Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX3P78415 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX3P78415 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX3P78415 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX3P78415 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX3P78415 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX3P78415 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX3P78415 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX3P78415 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRX3P78415 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRX3P78415 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRX3P78415 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX3P78415 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX3P78415 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX3P78415 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX3P78415 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX3P78415 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX3P78415 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX3P78415 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRX3P78415 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRX3P78415 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRX3P78415 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
IRX3P78415 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX3P78415 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms