Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX4P78413 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX4P78413 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX4P78413 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX4P78413 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX4P78413 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX4P78413 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX4P78413 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX4P78413 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX4P78413 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX4P78413 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX4P78413 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX4P78413 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX4P78413 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms