Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPNP63162 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms