Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1LP55160 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1LP55160 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms