Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUMBP49757 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUMBP49757 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUMBP49757 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUMBP49757 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUMBP49757 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUMBP49757 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUMBP49757 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUMBP49757 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUMBP49757 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUMBP49757 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUMBP49757 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUMBP49757 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUMBP49757 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUMBP49757 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUMBP49757 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUMBP49757 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUMBP49757 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms