Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 BRD3-205ENST00000473349 761 ntTSL 310.28□□□□□ -0.766e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.966e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 26.52□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 SUPT16H-206ENST00000556309 582 ntTSL 33.98□□□□□ -1.776e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 38.6
AARSP49588 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■■ 38.6
AARSP49588 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 38.6
AARSP49588 TRIM25-205ENST00000572021 1555 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 38.6
AARSP49588 STT3B-202ENST00000423527 1664 ntTSL 227.59■■■□□ 2.017e-12■■■■■ 38.5
AARSP49588 STT3B-204ENST00000453168 1888 ntTSL 1 (best)27.06■■□□□ 1.927e-12■■■■■ 38.5
AARSP49588 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-12■■■■■ 38.5
AARSP49588 STT3B-205ENST00000462235 801 ntTSL 32.64□□□□□ -1.997e-12■■■■■ 38.5
AARSP49588 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-9■■■■■ 38.3
AARSP49588 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 38.3
AARSP49588 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 316.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 522.71■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 38.3
AARSP49588 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 218.79■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 38.1
AARSP49588 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 38.1
AARSP49588 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 414.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 38.1
AARSP49588 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 230■■■□□ 2.392e-6■■■■■ 38
AARSP49588 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 321.24■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 38
AARSP49588 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 38
AARSP49588 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 315.95■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.244e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 324.99■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 524.65■■□□□ 1.544e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 518.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 217.47■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 38
AARSP49588 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 316.35■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 38
AARSP49588 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.428e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.058e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.448e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.458e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.548e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 37.8
AARSP49588 CA8-202ENST00000524872 1825 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.757e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.267e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.017e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.117e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.197e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 CA8-203ENST00000528666 510 ntTSL 38.5□□□□□ -1.057e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.717e-10■■■■■ 37.8
AARSP49588 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 37.7
AARSP49588 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 37.7
AARSP49588 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 519.9■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 37.7
AARSP49588 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 37.3
AARSP49588 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 37.1
AARSP49588 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 516.16■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 410.18□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 37.1
AARSP49588 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.925e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 219.97■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 SMARCC2-214ENST00000552674 3730 ntTSL 210.4□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 36.5
AARSP49588 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 36.4
AARSP49588 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.654e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.964e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 SSBP3-210ENST00000525990 701 ntTSL 213.1□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 310.47□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 36.2
AARSP49588 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.431e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.161e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.961e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.911e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)26.4■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.791e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 525.6■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZHX3-215ENST00000559296 258 ntTSL 525.37■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CTSZ-204ENST00000503833 955 ntTSL 1 (best)24.06■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)23.99■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 RPS6KB2-210ENST00000530623 569 ntTSL 423.92■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GAB2-206ENST00000530915 567 ntTSL 423.6■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 36.1
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 86.8 ms