Protein–RNA interactions for Protein: P47736

RAP1GAP, Rap1 GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GAPP47736 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAP1GAPP47736 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAP1GAPP47736 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GAPP47736 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms