Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms